MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 47491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007181	ATT	2	6	59	64	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007181	AG	3	6	200	205	50 %	0 %	50 %	0 %	70605854
3	NC_007181	AG	3	6	215	220	50 %	0 %	50 %	0 %	70605854
4	NC_007181	ACCGGA	2	12	287	298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70605854
5	NC_007181	AGG	2	6	336	341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70605854
6	NC_007181	AAG	2	6	344	349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605854
7	NC_007181	AGGT	2	8	399	406	25 %	25 %	50 %	0 %	70605854
8	NC_007181	GAG	2	6	455	460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70605854
9	NC_007181	AGAA	2	8	496	503	75 %	0 %	25 %	0 %	70605854
10	NC_007181	TAG	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605854
11	NC_007181	AT	3	6	536	541	50 %	50 %	0 %	0 %	70605854
12	NC_007181	ACT	2	6	598	603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605854
13	NC_007181	GTAA	2	8	635	642	50 %	25 %	25 %	0 %	70605854
14	NC_007181	ATG	2	6	717	722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605854
15	NC_007181	ATTA	2	8	766	773	50 %	50 %	0 %	0 %	70605854
16	NC_007181	AT	3	6	802	807	50 %	50 %	0 %	0 %	70605854
17	NC_007181	TGC	2	6	808	813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70605854
18	NC_007181	GCT	2	6	869	874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70605854
19	NC_007181	GGAA	2	8	889	896	50 %	0 %	50 %	0 %	70605854
20	NC_007181	ATA	2	6	926	931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605854
21	NC_007181	AG	3	6	943	948	50 %	0 %	50 %	0 %	70605854
22	NC_007181	AGCT	2	8	987	994	25 %	25 %	25 %	25 %	70605854
23	NC_007181	AGA	2	6	1088	1093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605854
24	NC_007181	TAA	2	6	1131	1136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605854
25	NC_007181	ATA	2	6	1145	1150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605854
26	NC_007181	AAGGG	2	10	1154	1163	40 %	0 %	60 %	0 %	70605854
27	NC_007181	GGA	2	6	1166	1171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70605854
28	NC_007181	AGA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605855
29	NC_007181	GAG	3	9	1326	1334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70605855
30	NC_007181	TAT	3	9	1426	1434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605855
31	NC_007181	AGTA	2	8	1465	1472	50 %	25 %	25 %	0 %	70605855
32	NC_007181	AGA	2	6	1551	1556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605855
33	NC_007181	AATAG	2	10	1561	1570	60 %	20 %	20 %	0 %	70605855
34	NC_007181	TAG	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605855
35	NC_007181	TA	3	6	1633	1638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007181	ATT	2	6	1746	1751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605856
37	NC_007181	AAT	2	6	1766	1771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605856
38	NC_007181	AT	3	6	1799	1804	50 %	50 %	0 %	0 %	70605856
39	NC_007181	TAG	2	6	1828	1833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605856
40	NC_007181	AGT	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605856
41	NC_007181	ATA	3	9	1914	1922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605856
42	NC_007181	AT	3	6	1973	1978	50 %	50 %	0 %	0 %	70605856
43	NC_007181	TTAC	2	8	2025	2032	25 %	50 %	0 %	25 %	70605856
44	NC_007181	TGC	2	6	2102	2107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70605856
45	NC_007181	TAA	2	6	2149	2154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605856
46	NC_007181	TGC	2	6	2159	2164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70605856
47	NC_007181	ATT	2	6	2259	2264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605856
48	NC_007181	AT	3	6	2309	2314	50 %	50 %	0 %	0 %	70605856
49	NC_007181	TAA	2	6	2371	2376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605856
50	NC_007181	TTA	2	6	2448	2453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605856
51	NC_007181	AT	3	6	2463	2468	50 %	50 %	0 %	0 %	70605856
52	NC_007181	TGA	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605856
53	NC_007181	AAAG	2	8	2559	2566	75 %	0 %	25 %	0 %	70605857
54	NC_007181	T	6	6	2570	2575	0 %	100 %	0 %	0 %	70605857
55	NC_007181	TTTA	2	8	2625	2632	25 %	75 %	0 %	0 %	70605857
56	NC_007181	CTTCCT	2	12	2708	2719	0 %	50 %	0 %	50 %	70605857
57	NC_007181	TTA	2	6	2771	2776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605857
58	NC_007181	CAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70605857
59	NC_007181	CTCTTG	2	12	2831	2842	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	70605857
60	NC_007181	TTA	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605857
61	NC_007181	A	6	6	2878	2883	100 %	0 %	0 %	0 %	70605857
62	NC_007181	TTA	2	6	2932	2937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605857
63	NC_007181	ATA	2	6	2946	2951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605857
64	NC_007181	A	6	6	2972	2977	100 %	0 %	0 %	0 %	70605857
65	NC_007181	TCT	2	6	3070	3075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605857
66	NC_007181	T	6	6	3138	3143	0 %	100 %	0 %	0 %	70605858
67	NC_007181	AAAC	2	8	3166	3173	75 %	0 %	0 %	25 %	70605858
68	NC_007181	TTA	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605858
69	NC_007181	TAACT	2	10	3346	3355	40 %	40 %	0 %	20 %	70605858
70	NC_007181	ATT	2	6	3367	3372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605858
71	NC_007181	ACTTCA	2	12	3374	3385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605858
72	NC_007181	TCT	2	6	3388	3393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605858
73	NC_007181	TTA	2	6	3470	3475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605858
74	NC_007181	TAG	2	6	3565	3570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605858
75	NC_007181	TATG	2	8	3634	3641	25 %	50 %	25 %	0 %	70605858
76	NC_007181	TTG	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70605858
77	NC_007181	ATAA	2	8	3690	3697	75 %	25 %	0 %	0 %	70605858
78	NC_007181	TTG	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70605858
79	NC_007181	A	6	6	3719	3724	100 %	0 %	0 %	0 %	70605858
80	NC_007181	TAA	2	6	3782	3787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007181	AT	3	6	3789	3794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007181	A	6	6	3795	3800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007181	AAT	2	6	3923	3928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605859
84	NC_007181	CT	3	6	3982	3987	0 %	50 %	0 %	50 %	70605859
85	NC_007181	TCC	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70605859
86	NC_007181	T	7	7	4131	4137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007181	ATGG	2	8	4143	4150	25 %	25 %	50 %	0 %	70605860
88	NC_007181	AAC	2	6	4168	4173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70605860
89	NC_007181	TTA	2	6	4200	4205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605860
90	NC_007181	TAA	2	6	4237	4242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605860
91	NC_007181	AGA	2	6	4244	4249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605860
92	NC_007181	CATA	2	8	4284	4291	50 %	25 %	0 %	25 %	70605860
93	NC_007181	ATA	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605860
94	NC_007181	AG	3	6	4345	4350	50 %	0 %	50 %	0 %	70605860
95	NC_007181	GAA	2	6	4365	4370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605860
96	NC_007181	AT	3	6	4426	4431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007181	CTAA	2	8	4442	4449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007181	A	6	6	4448	4453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007181	ACT	2	6	4504	4509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605861
100	NC_007181	TCT	2	6	4562	4567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605861
101	NC_007181	AAT	2	6	4571	4576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605861
102	NC_007181	TCC	2	6	4640	4645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70605861
103	NC_007181	CTAC	2	8	4649	4656	25 %	25 %	0 %	50 %	70605861
104	NC_007181	AGTG	2	8	4691	4698	25 %	25 %	50 %	0 %	70605861
105	NC_007181	TCT	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605861
106	NC_007181	TCT	2	6	4921	4926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605861
107	NC_007181	TTC	2	6	4927	4932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605861
108	NC_007181	CTT	2	6	5028	5033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605861
109	NC_007181	CTA	2	6	5043	5048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605861
110	NC_007181	TA	3	6	5103	5108	50 %	50 %	0 %	0 %	70605861
111	NC_007181	GTA	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605861
112	NC_007181	GA	3	6	5348	5353	50 %	0 %	50 %	0 %	70605862
113	NC_007181	CTC	2	6	5425	5430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70605862
114	NC_007181	GAGG	2	8	5524	5531	25 %	0 %	75 %	0 %	70605862
115	NC_007181	CTT	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605862
116	NC_007181	TA	3	6	5591	5596	50 %	50 %	0 %	0 %	70605862
117	NC_007181	AGT	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605862
118	NC_007181	CTT	2	6	5734	5739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605862
119	NC_007181	AAT	2	6	5757	5762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605862
120	NC_007181	TCT	2	6	5881	5886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605862
121	NC_007181	TGA	2	6	5898	5903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605862
122	NC_007181	CAT	2	6	6099	6104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605862
123	NC_007181	CTAA	2	8	6304	6311	50 %	25 %	0 %	25 %	70605863
124	NC_007181	ATT	2	6	6352	6357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605863
125	NC_007181	TGG	2	6	6369	6374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70605863
126	NC_007181	ATG	2	6	6452	6457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605863
127	NC_007181	ATA	2	6	6472	6477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605863
128	NC_007181	T	7	7	6494	6500	0 %	100 %	0 %	0 %	70605863
129	NC_007181	TTG	2	6	6518	6523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70605863
130	NC_007181	TCC	2	6	6596	6601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70605863
131	NC_007181	GAT	2	6	6615	6620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605863
132	NC_007181	AAT	2	6	6636	6641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605863
133	NC_007181	AAT	2	6	6650	6655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605863
134	NC_007181	CTA	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605863
135	NC_007181	GAA	2	6	6714	6719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605863
136	NC_007181	TTA	2	6	6803	6808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605863
137	NC_007181	ATG	2	6	6856	6861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605863
138	NC_007181	TAA	2	6	6869	6874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605863
139	NC_007181	AAGC	2	8	6956	6963	50 %	0 %	25 %	25 %	70605863
140	NC_007181	GGCTAA	2	12	6987	6998	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	70605863
141	NC_007181	TCC	2	6	7005	7010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70605863
142	NC_007181	TTC	2	6	7018	7023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605863
143	NC_007181	GGT	2	6	7081	7086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70605863
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159	NC_007181	AGA	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_007181	CAT	2	6	7816	7821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605864
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176	NC_007181	TTA	2	6	8316	8321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_007181	CT	3	6	13207	13212	0 %	50 %	0 %	50 %	70605872
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391	NC_007181	TGT	2	6	18312	18317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70605878
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401	NC_007181	ATA	2	6	18752	18757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605879
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405	NC_007181	CTT	2	6	18950	18955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605880
406	NC_007181	CAT	2	6	18979	18984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605880
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